过氧化氢在食品中的应用至少有50多年历史，一直被认为是安全可靠的。上世纪80年代初，科学家发现它可能损伤小白鼠的胃肠道，甚至可能有致性。但是1988年，美国FDA的评估委员会经过慎重研究认为，过氧化氢致证据不足。国际研究机构在1999年的评估意见也认为，过氧化氢导致人和动物的证据不足，归为3类物质（不太可能导致的物质），同属这一类的还有茶、维生素K、铁锈等等。有少量体外细胞实验发现过氧化氢有一定的遗传毒性，但是在动物实验中并没有发现。这是由于动物机体有足够的的防御体系，它很难通过消化道进入体内细胞并损伤DNA。另外也没有足够证据表明它影响动物的生殖能力 。
过氧化氢生产过程中，氢化液槽、氧化液贮槽、循环工作液槽、粗芳烃贮槽、工作液贮槽都存在混入空气或过氧化氢分解而发生的风险。要求采用氮封或液封的方式避免易燃易爆混合气体在容器内聚集。要求在氧化液贮槽和成品槽等含过氧化氢的其他设备设置泄压设施。需要引以为戒的是，某公司萃取塔超压放空跑料事故中，所有中间贮槽都增加了稀释保护用氮气，但酸性系统、碱性系统人为地用氮气系统连了起来，结果因阀门内漏，造成碱性系统的物料串入到酸性系统中，从而引发过氧化氢分解超压。
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